Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDE4DQ08499 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms