Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOS1Q07889 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms