Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPL2Q05D32 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms