Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7AQ04656 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP7AQ04656 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms