Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC25A11Q02978 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms