Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SIM1P81133 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIM1P81133 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIM1P81133 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms