Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM193AP78312 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms