Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P62684 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P62684 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms