Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF6P62330 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms