Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAD23AP54725 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms