Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP2S1P53680 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP2S1P53680 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms