Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOSBP53539 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOSBP53539 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOSBP53539 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOSBP53539 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOSBP53539 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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