Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms