Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBP2P50120 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBP2P50120 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms