Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms