Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP5P45974 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP5P45974 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP5P45974 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP5P45974 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP5P45974 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP5P45974 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP5P45974 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP5P45974 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms