Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRATP43155 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRATP43155 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRATP43155 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRATP43155 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms