Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms