Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPB2P35606 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COPB2P35606 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPB2P35606 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPB2P35606 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms