Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms