Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTX2P32243 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTX2P32243 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms