Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CSRP3-201ENST00000265968 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FGF1-206ENST00000407758 759 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD11P31277 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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