Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC12P31275 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms