Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1BP29016 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms