Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSFA2P28290 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms