Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms