Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms