Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PVALBP20472 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PVALBP20472 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms