Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF3P18847 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF3P18847 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATF3P18847 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATF3P18847 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms