Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSPP15924 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSPP15924 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSPP15924 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms