Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFTRP13569 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFTRP13569 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CFTRP13569 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFTRP13569 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CFTRP13569 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CFTRP13569 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CFTRP13569 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CFTRP13569 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms