Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP3P12645 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP3P12645 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP3P12645 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BMP3P12645 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BMP3P12645 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP3P12645 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP3P12645 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms