Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DMDP11532 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DMDP11532 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DMDP11532 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DMDP11532 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DMDP11532 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DMDP11532 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DMDP11532 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DMDP11532 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms