Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCL3P10147 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms