Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLI3P10071 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI3P10071 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms