Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms