Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM225BP0DP42 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms