Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms