Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PGA3P0DJD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms