Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VIL1P09327 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms