Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP10P09238 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMP10P09238 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms