Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFDP00746 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFDP00746 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFDP00746 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms