Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSD2O96028 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSD2O96028 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSD2O96028 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSD2O96028 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms