Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA4FO95754 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4FO95754 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms