Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB5O95377 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB5O95377 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB5O95377 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB5O95377 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB5O95377 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB5O95377 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms