Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4AO75164 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4AO75164 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms