Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms