Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX16O60231 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX16O60231 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms