Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR3O43761 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms