Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms